净化车间工程可分为空气净化与水净化，空气净化是在一定空间范围内，将空气中的微粒子、有害空气、细菌等污染物排除，并将室内温度、洁净度、压力、气流速度与气流分布、噪音振动及照明、静电控制在某一需求范围内的工程学科。

净化车间工程整个系统下来，按照树形结构来看的话，主干分别为：地面系统、风管系统、自控系统、电气系统、给排水系统、空气过滤系统。

地面系统：一般采用环氧树脂洁净地面。 围护结构系统：简单说是顶、墙、地三部分，即组成三维密闭空间的六个面。往细的说包括门窗、装饰圆弧等。

风管系统：包括送风、回风、新风、排风管道、末端及控制装置等；空调系统：包括冷（热）水机组（包括水泵、冷却塔等）（或风冷管道机级等），管路、组合式净化空调箱（包括混流段、初效段、加热段、制冷段、除湿段、加压段、中效段、静压段等）。

自控系统：包括温度控制、温度控制、风量风压控制、开启顺序和时间控制等。

电气系统：照明、动力、弱电三部分，包括净化灯具、插座、电气柜、线路、监控、电话等强弱电系统。

给排水系统：给水、排水管道、设施及控制装置等。

初中高效过滤器等其他净化设备：如臭氧、紫外线灯、风淋（包括货淋）、传递窗、超净工作台,互联锁等净化辅助设备。